李虹

李虹

中国科学院上海营养与健康研究所 · 研究员、博士生导师、系统生物学研究组组长

国家优秀青年科学基金获得者

科研界上海
肿瘤系统生物学空间组学单细胞组学人工智能精准用药

个人简介

李虹为中国科学院上海营养与健康研究所研究员、博士生导师、系统生物学研究组组长,入选国家优秀青年科学基金。她具有信息与计算科学及生物信息学背景,长期从事肿瘤系统生物学研究,重点开发多组学、多模态、单细胞和空间组学的人工智能方法,并应用于肿瘤微环境、肝纤维化靶点、癌症演化和个体化用药。其团队已发表六十余篇论文,持续建设开放分析工具与药物响应预测模型。

专业成就

1. 建立面向肿瘤系统生物学的多组学和人工智能研究体系,连接基因组、单细胞、空间与临床数据。

2. 开发SOAPy空间组学工具包及JointSyn、DiSyn药物响应模型,形成开放可复用的计算工具。

3. 主持国家自然科学基金、中国科学院和上海市项目十余项,推动计算方法服务精准治疗研究。

科研成果

1. 开发SOAPy空间组学集成分析工具,从空间域、趋势、生态位和细胞通讯等维度解析组织微环境。

2. 构建JointSyn和DiSyn模型,分别提升药物组合协同预测及从细胞系向患者数据迁移的准确性。

3. 系统解析11种癌症的空间生态位,发现与预后和免疫治疗响应相关的免疫热型及免疫抑制型微环境。

荣誉奖项

国家优秀青年科学基金获得者。

中国科学院青年创新促进会会员。

行业贡献

1. 开放SOAPy代码和空间组学分析流程,降低肿瘤与发育研究中空间数据解析门槛。

2. 以AI模型为单药、联合用药和免疫治疗患者分层提供量化依据,支持精准用药研发。

3. 通过生物医学大数据平台和交叉培养,将计算科学方法推广至临床和生命科学团队。