陈磊
上海交通大学医学院附属仁济医院 · 研究员、课题组长
科研界上海
生物信息学微生物组学基因组学单细胞组学免疫微生态
个人简介
陈磊为上海交通大学医学院附属仁济医院研究员、课题组长，较新的医学院博士招生资料将其列于仁济医院，研究方向为微生物组、测序相关生物信息及单细胞测序。2005年获复旦大学生物学学士学位，2010年获美国贝勒医学院博士学位，随后在圣路易斯华盛顿大学从事博士后研究，并在美国杰克逊基因组医学实验室担任生物信息分析师。2016年加入上海交通大学医学院，早期组建基因组与微生物组学研究组，研究测序数据、人体菌群及其与疾病的关系。
专业成就
1. 建立基因组与微生物组学研究团队，开展测序数据分析与人体微生物群研究。
2. 参与美国人类微生物组计划相关测序分析，并推动单细胞与微生物组方法在疾病研究中应用。
3. 在上海交通大学医学院指导微生物组、单细胞测序和生物信息方向研究生。
科研成果
1. 作为通讯作者研究克罗恩病不同阶段唾液微生物组动态，成果发表于Frontiers in Cellular and Infection Microbiology（2020）。
2. 参与评估16S rRNA测序在菌种及菌株水平微生物组分析中的分辨能力，成果发表于Nature Communications（2019）。
3. 参与多位点微生物组纵向研究，分析健康与疾病状态下菌群稳定性和个体差异，成果发表于2024年同行评审论文。
行业贡献
1. 指导单细胞转录组与微生物组分析研究，并参与医学院研究生培养。
2. 受邀在上海交通大学医学院临床研究论坛讲授新冠病毒转录组数据挖掘方法。